В мире этого сериала Digimon — медиафраншиза, в которую входят игрушки и коллекционные карты, соответственно, Digimon Adventure и Digimon Adventure 02 во вселенной Tamers — всего лишь анимационные сериалы, а сами дигимоны — вымышленные существа из этой медиафраншизы. В сериале появляются новые персонажи-люди и дигимоны, из которых главными героями являются Такато Мацуда и Гилмон, Руки Макино и Ренамон, Ли Цзяньлян и Терьермон. Digimon Tamers никак не связан с событиями предыдущих аниме-сериалов, а его сюжет разворачивается в основном в реальном мире. В начале главные герои сталкиваются с тайной правительственной службой по борьбе с дигимонами «Гинпос», позже они отправляются в Цифровой мир и встречаются с четырьмя священными дигимонами-зверями, от которых они узнают о существовании разрушительного компьютерного вируса — «Цифрового жнеца», способного уничтожить оба мира.